Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NAE1Q13564 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NAE1Q13564 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NAE1Q13564 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NAE1Q13564 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NAE1Q13564 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NAE1Q13564 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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NAE1Q13564 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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NAE1Q13564 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAE1Q13564 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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