Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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