Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
XRCC4Q13426 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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