Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms