Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BNIP1Q12981 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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