Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTP4A2Q12974 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms