Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FOXO1Q12778 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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