Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCBP1Q09161 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms