Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYP4F3Q08477 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms