Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPN11Q06124 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms