Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHRNEQ04844 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHRNEQ04844 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms