Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMX2Q04743 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms