Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSG1Q02413 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms