Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms