Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A2Q01362 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms