Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUCB2P80303 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms