Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HBBP68871 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HBBP68871 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HBBP68871 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms