Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB11AP62491 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms