Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms