Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTCP1P56278 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms