Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPD52P55327 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPD52P55327 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TPD52P55327 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TPD52P55327 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms