Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC12A2P55011 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC12A2P55011 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms