Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1B3P54709 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms