Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP2S1P53680 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms