Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKX2-5P52952 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX2-5P52952 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms