Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL35P42766 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL35P42766 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL35P42766 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms