Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASP2P42575 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms