Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms