Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms