Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CASQ1P31415 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CASQ1P31415 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CASQ1P31415 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CASQ1P31415 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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