Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX2P28328 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms