Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOP2AP11388 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOP2AP11388 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms