Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms