Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM200BP0CF97 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms