Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4BP0C0L5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms