Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTCP00480 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTCP00480 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTCP00480 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTCP00480 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms