Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTL6BO94805 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms