Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCNKO75909 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCNKO75909 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCNKO75909 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms