Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RBBP9O75884 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms