Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSVO60911 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSVO60911 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms