Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF3O43395 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms