Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXNB1O43157 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXNB1O43157 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms