Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FANCAO15360 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FANCAO15360 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FANCAO15360 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FANCAO15360 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FANCAO15360 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FANCAO15360 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FANCAO15360 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms