Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4O14817 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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