Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APAF1O14727 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APAF1O14727 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms