Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIP1O00291 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIP1O00291 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIP1O00291 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms