Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H7C1C5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H7C1C5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H7C1C5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H7C1C5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H7C1C5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H7C1C5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms