Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B4DXG7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B4DXG7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B4DXG7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B4DXG7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms