Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POTEMA6NI47 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POTEMA6NI47 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms