Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LRP5LA4QPB2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP5LA4QPB2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP5LA4QPB2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP5LA4QPB2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP5LA4QPB2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LRP5LA4QPB2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms